Lietuvos Biotechnologijos instituto mokslininkai nuo šiol bioinformatikos tyrimuose naudos didelio našumo 25 „ProLiant“ serverių grupę, veikiančią kaip viena galinga sistema (klasterį). Šis sprendimas, kuris yra apie 10 kartų galingesnis už iki šiol naudotąjį institute, leis paspartinti skaičiavimus bioinformatikos srities tyrimuose. Jį įdiegė pasaulinė IT sprendimų kompanija „Hewlett-Packard“ (HP) kartu su verslo partnere Lietuvos bendrove „B.G.M.“.
Instituto atstovų teigimu, baltymų struktūrų tyrimai, kuriems nuo šiol bus pasitelkta HP įranga, yra itin reikšmingi, kadangi baltymai yra svarbi žmogaus kūno dalis, dalyvaujanti organizmo gyvybiniuose procesuose: kovoje su infekcija, virškinime, deguonies pernešime ir kituose.
„Institute įdiegta naujovė leis žymiai greičiau atlikti skaičiavimus tyrimų metu, taip pat vienu metu vykdyti kelias didelių resursų reikalaujančias užduotis. HP sprendimą pasirinkome kaip geriausiai atitinkantį mūsų dabartinius poreikius“, – sakė Biotechnologijos instituto Bioinformatikos laboratorijos vadovas Česlovas Venclovas.
Anot Č. Venclovo, tyrimų metu Biotechnologijos instituto Bioinformatikos laboratorijos specialistai bando sumodeliuoti vieno ar kito baltymo erdvinę struktūrą ir, pasinaudodami šiais modeliais, suprasti, kaip šie baltymai veikia ir kokia jų nauda žmogui. Tokių tyrimų rezultatai gali būti pritaikyti naujų vaistų gamyboje farmacijos srityje arba medicinoje, kuriant baltymus su naujomis savybėmis.
Jo teigimu, dideli kompiuterių skaičiavimo pajėgumai reikalingi tiriant baltymų sekas ir struktūras, kuriant naujus metodus ir tikrinant hipotezes, kuomet realūs eksperimentai nėra vykdomi, o modeliuojami pasitelkus matematikos metodus.
„HP didelio našumo klasterių sprendimai išsiskiria išbaigtumu ir funkcionalumu ir yra vieni pirmaujančių pasaulyje. Džiaugiamės, kad pirmasis toks sprendimas Baltijos šalyse pasitarnaus aktualiems mokslo tyrimams Lietuvoje“, – sakė HP „ProLiant“ serverių pardavimų vadovas Baltijos šalyse Vladimiras Silkovas.
Šalies Biotechnologijos insitute įdiegto vieno galingiausių ir pirmojo tokio Baltijos šalyse „High Performance Computing“ (HPC) klasterio skaičiavimo pajėgumai prilygsta nedideliam superkompiuteriui. Šie klasteriai naudojami lygiagretiems ir paskirstytiems skaičiavimams atlikti.
„Iki šiol Lietuvoje įdiegtose didelių pajėgumų kompiuterių platformose buvo naudojama kelių gamintojų techninė įranga ir sprendimai, tuo tarpu Biotechnologijos instituto Bioinformatikos laboratorijoje pasitelktas pirmasis vieno gamintojo sprendimas, pasižymintis geru našumo, kokybės bei kainos santykiu“, – teigia UAB „B.G.M.“ vykdomasis direktorius Martynas Birmontas.
Biotechnologijos instituto laboratorijoje įdiegtą HP HPC serverių grupę sudaro 25 „ProLiant“ serveriai. Kiekvienas serveris naudoja po 2 dviejų branduolių 3 Ghz spartos procesorius „Intel Xeon 5160“. 100 branduolių naudojančio sprendimo teorinė sparta siekia 1,2 trilijono slankiojo kablelio operacijų per sekundę arba 1,2 teraflopo. Kompiuterių grupės priežiūrai ir darbinių resursų valdymui naudojama speciali programinė įranga „Scali Manage“.
HP HPC sprendimas Biotechnologijos institute buvo įdiegtas per 6 mėnesius, investicijos į jį siekė apie 0,5 mln. litų. Šio sprendimo diegimu rūpinosi „B.G.M.“ bendrovės specialistai, kurie padėjo pasirinkti tinkamą skaičiavimo platformą ir jos elektros maitinimo sistemą, paruošė serverių grupę eksploatacijai, įdiegė reikalingą programinę įrangą ir atliko mokymus. Visą reikalingą techninę ir programinę įrangą serverių grupės sprendimui pateikė HP.
HP didelio našumo klasterių sprendimai naudojami įvairių sričių tyrimuose, atliekant projektavimo darbus, kompiuterinei animacijai ir kuriant filmų specialiuosius efektus. Galingiausi HP sprendimais paremti didelio našumo klasteriniai sprendimai veikia Los Almos nacionalinėje laboratorijoje JAV, Karlsruho universiteto moksliniame superkompiuterių centre Vokietijoje, puslaidininkių kompanijoje Jungtinėje Karalystėje ir kitur.
Paieška archyve
